2012年三只松鼠成立，其累计完成总额达750万美元的两轮融资，具体为：2012年3月获得IDG资本150万美元A轮投资，2013年5月获得今日资本600万美元B轮投资。

2014年，安徽三只松鼠电子商务有限公司再次获得今日资本、IDG资本两家境外基金第三轮1627万美元（折合1.2亿人民币）天使投资，用于三只松鼠智能一体化食品园项目建设。

2015年9月16日，三只松鼠创始人章燎原在安徽芜湖宣布，三只松鼠已获得第四轮融资，总金额达3亿元人民币，三只松鼠估值40亿元。

2017年04月22日，休闲食品电商“三只松鼠”正式提交上市招股书，拟登陆创业板。

2017年08月15日药监总局关于3批次食品不合格情况的通告（2017年第135号）指出，天猫超市在天猫（网站）商城销售的标称三只松鼠股份有限公司生产的开心果，霉菌检出值为70CFU/g，比国家标准规定（不超过25CFU/g）高出1.8倍。检验机构为上海市食品药品检验所。

2017年12月12日，证监会发布公告称，鉴于三只松鼠股份有限公司尚有相关事项需要进一步核查，决定取消第十七届发审委第72次发审委会议对该公司发行申报文件的审核。根据证监会此前安排，三只松鼠的IPO申请会在12月13日上会接受审核。

2018年6月25日，证监会网站显示，三只松鼠正进入IPO排队阶段，其审核状态显示为“预先披露更新”。

2016年、2017年、2018年，三只松鼠的营收分别为44.23亿元、55.54亿元、70.01亿元，净利润分别为2.36亿元、3.02亿元、3.04亿元。2019年1月至3月，三只松鼠实现营业收入28.7亿元，同比增长27.17%；归属于母公司股东的净利润为2.49亿元，同比增长6.95%；扣除非经常性损益后归属于母公司股东净利润为2.47亿元，同比增长6.84%。

2018年三只松鼠营业额高达70亿元，净利润3.04亿元，净利率4％。按照三只松鼠各项费用支出计算，如果平均客单价为100元／单，平均每单需要支付7元快递费，平台每单抽成3.55元，包装费用大概3元，推广费用摊平到每一单上的费用为2元，再加上相关的运营费用、职工薪酬，仅仅是在平台上，达成一单买卖就需要支付约20元的费用，再加上原材料成本，最终每单能赚到的净利润甚至不到10块钱。[8]

2019年5月10日，证监会官网显示，“互联网休闲零食网红”三只松鼠股份有限公司将于5月16日首发上会。

2019年6月18日，原定于6月12日进行的网上、网下申购将推迟至7月3日，原定于6月11日举行的网上路演也推迟至7月2日。

2019年7月10日，三只松鼠发布公告称，将发行的普通股股票，于7月12日在深交所创业板上市。

2019年7月12日，三只松鼠食品股份有限公司（简称“三只松鼠”）在深交所挂牌上市，股票简称为“三只松鼠”，股票代码为“300783”。[9]

2020年4月2日，休闲食品品牌三只松鼠发布公告称，拟使用自有资金4225.62万元投资设立4家全资子公司，子公司业务包括销售酱腌菜、婴童食品、宠物食品以及礼品等。 

2022年4月23日，三只松鼠发布了《关于全面推进战略转型升级、迈向高质量发展的重要公告》，公告称，“从高质量发展的角度审视，过去门店规模化、粗放型的发展模式存在问题，为此公司已全面暂停门店扩张，并且大力度关停不符合长期定位、业绩不佳的门店，下一步将着力提升单店盈利能力，聚焦优质门店的高质量发展。”

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